As palavras genómicas são sequências de nucleótidos, as quatro letras que compõe o ADN, responsáveis pela expressão de proteínas específicas. A matemática pode ser usada para reconhecer estes padrões e identificar sequências de nucleótidos capazes de “escrever” palavras genómicas com um comportamento atípico.
Vera Afreixo, professora auxiliar no Departamento de Matemática (MAT) da Universidade de Aveiro (UA), estuda métodos matemáticos de probabilidade e estatística com aplicações na genómica, na bioinformática e nos sistemas biológicos.
“O ADN para os matemáticos pode ser visto de uma forma muito simples como uma sequência de quatro letras. Essas quatro letras são os nucleótidos, a Adenina, a Timina, a Citosina e a Guanina. E nós acreditamos que de facto estas sequências genómicas vistas assim como longas sequências de quatro letras têm uma organização não aleatória, têm uma estrutura específica”, explica.
Segundo a investigadora, é possível olhar para a sequência como uma longa sequência de quatro letras, ou então como partes compostas por pequenas sequências, como grupos de 7 letras.
“O nome que damos a estas sequências são palavras genómicas. Tem especial interesse para nós encontrar palavras genómicas que possam ter um comportamento atípico, diferente ao longo desta sequência. Podendo traduzir-se esse comportamento atípico na expressão de algumas estruturas biológicas”, acrescenta.
Para Vera Afreixo, uma aplicação deste procedimento de análise das distâncias entre palavras genómicas é a análise estrutural e funcional do próprio genoma, para melhor compreender como estas palavras se formam e como um eventual comportamento atípico das mesmas pode afetar a forma como um determinado gene é expresso.
Saiba mais sobre a investigadora em: ResearchGate | UA
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