Estas técnicas computacionais já permitiram identificar relações entre moléculas envolvidas no processo tumoral.
Manuel Melo, investigador no Laboratório de Modelação Multiescala no Instituto de Tecnologias Químicas e Biológicas António Xavier (ITQB NOVA), usa uma técnica computacional chamada de dinâmica molecular para simular e estudar o comportamento de moléculas.
A partir destas simulações é possível estudar como estas moléculas se movem, como interagem umas com as outras, e que preferências têm umas com as outras.
“Conseguimos já identificar uma série de interações e de parcerias que as moléculas gostam de estabelecer. E conseguimos fazer isto a um nível muito fino”, acrescenta.
Os resultados destas simulações precisam no entanto de serem validados em laboratório. Nesse sentido, a equipa de Manuel Melo colabora com um grupo de bioquímicos que, por via desta colaboração, identificaram uma interacção entre duas moléculas nas mitocôndrias que leva à apoptose da célula.
A apoptose é a morte celular programada, também conhecida como suicídio celular, e está muito ligada a questões oncológicas, pois quando uma célula não se mata quando se devia matar esta pode dar origem a um tumor.
Esta técnica computacional permite ir um pouco mais longe e não só identificar que estas moléculas interagem, mas também como, de que maneira, e em que sítio de cada uma.
“Com as nossas simulações conseguimos perceber que havia esse tipo de interação e como nós temos o detalhe molecular conseguimos ver não só que há interação mas também em que região específica”, reforça.
A partir desses dados é possível simular diferentes cenários para prever o que acontece se for modificada uma proteína numa determinada zona de ligação.
Os resultados são depois testados em laboratório para validar o que foi descoberto. Desta forma é possível acelerar o estudo destas interações e possivelmente encurtar o tempo de desenvolvimento de futuros fármacos.
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